Struktur Organisasi Pimpinan STIT INSIDA Periode 2009 – 2013
| Ketua | : Prof. Dr. H. Ridlo Masduki |
| Puket I Akademik | : Dr. Rafiqurrahman, MA |
| Puket II Administrasi dan Keuangan | : Farida, M.Pd |
| Puket III Kemahasiswaan | : Miftachul Huda, M.Pd.I |
| KA. Prodi | : M. Misbah, M.Pd.I |
| Sek. Prodi | : Hasnida, M. Pd. |
Struktur Organisasi Pimpinan STIT INSIDA Periode 2013 – 2017
| Ketua | : Prof. Dr. H. Ridlo Masduki |
| Puket I Akademik | : Dr. Rafiqurrahman, MA |
| Puket II Administrasi dan Keuangan | : Farida, M.Pd |
| Puket III Kemahasiswaan | : Miftachul Huda, M.Pd.I |
| KA. Prodi | : M. Misbah, M.Pd.I |
| Sek. Prodi | : Hasnida, M. Pd. |
Struktur Organisasi Pimpinan STIT INSIDA Periode 2017 – 2022
| Ketua | : Dr. Rafiqurrahman, MA |
| Puket I Akademik | : Drs. M. Fakhuruddin, M.Si |
| Puket II Administrasi dan Keuangan | : Farida, M.Pd |
| Puket III Kemahasiswaan | : Muh. Misbah, M.Pd.I |
| KA. Prodi PAI dan PGMI | : Miftachul Huda, M.Pd.I |
| KA. Prodi PIAUD | : Hasnida, M. Pd. |
Struktur Organisasi Pimpinan STIT INSIDA Periode 2023 – 2026
| Ketua | : Dr. Hasnida, M. Pd. |
| Puket I Akademik & Perencanaan | : Dr. M. Misbah, M.Pd.I |
| Puket II Administrasi dan Keuangan | : Farida, M. Pd |
| Puket III Kemahasiswaan & Alumni | : Asep Kusnadi, M. Pd. |
| Puket IV Kerjasama | : Dr. Husni Alhan, MA. |
| Ka. Prodi PAI | : Dr. M. Misbah, M.Pd.I |
| Ka. Prodi PIAUD | : Farida, M. Pd |
| Ka. Prodi PGMI | : Kosim, M. Pd.I |